目前没有官方权威的宝可梦小说排行榜，以下是一些口碑较好、人气较高的宝可梦小说：

《我真没想当训练家啊》：作者北川南海，平行世界宝可梦流小说，将精灵世界与现实世界融合，讲述主角意外踏上训练家之路，最终成为世界锦标赛冠军的故事。

《精灵之短裤小子》：作者香辣豆瓣酱，是宝可梦同人文，初始神奇宝贝是波波，走平民路线，展现精灵世界的人文与发展。

《精灵养成游戏》：作者传语者，主角穿越到神奇宝贝世界，通过养成精灵展开冒险。

《宠物小精灵之庭树》：作者轻泉流响，无CP的宠物小精灵世界同人文，以难民开局，采用凡人流写法，是科技与玄幻融合的作品。

《精灵掌门人》：作者轻泉流响，字数较多，连载中。主角方缘拥有伊布等多种精灵，精灵个性刻画细致，文笔不错。

《神奇宝贝：完美开局》：作者黑白的假面，小说类型为同人、二次元，字数203万字（连载中），重生成为小智，开启新的传奇。

《宝可梦修改器》：作者骑车的风，已完结，约201万字。主角穿越到宝可梦世界后获得金手指“精灵修改器”和强大的古月鸟。

《精灵之性格大师》：作者爱人火枪手，主角的主要精灵有咸鱼王、呆呆兽、丑丑鱼等，风格轻松，主角是穿越到精灵宝可梦游戏世界中的高三精灵学院学生。

《精灵之黑暗崛起》：作者槿木槿木，主角重生，从火箭队一步一个脚印走向巅峰，等级和天赋设定符合大众，通俗易懂。

《精灵世界的底层训练家》：作者说唱鸽，讲述一个从底层一步一步爬上来的训练家的故事，文风偏